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En septembre 2009, la FNAB lance un observatoire des contaminations de produits bio en Europe. Elle fait appel à son réseau national, comme à ses partenaires en Europe, afin de lui faire part des cas de contaminations, quel que soit le taux, de produits bio. Tous les acteurs peuvent témoigner de façon anonyme : il ne s’agit aucunement de stigmatiser un tel ou un tel, tel ou tel opérateur, mais de suivre en temps réel l’évolution de ces contaminations.
Pour retrouver les contaminations des bio par les OGM
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 Les Fermiers de Loué (volailles de chair, œufs, label et bio) ont une politique très volontariste en matière de non contamination OGM de leur alimentation animale, avec des filières tracées et des engagements de progrès. Interrogés par la FNAB sur l’état de leur filière bio, les responsables de l’entreprise indiquent : « La partie bio (90 %) de l’aliment [des volailles] est concernée par la contamination fortuite en OGM. Dans le soja bio – en graines extrudées ou concassées - importé d’Italie, du Brésil et très exceptionnellement de Chine. Il peut être enregistré des contamination à des taux supérieurs à 0,1 % (et inférieurs à 0,9%). Dans la partie conventionnelle(10% de l'aliment des volailles bio), il peut être incorporé du tourteau de soja issu des filières tracées toujours pour apporter des protéines végétales et acides aminés indispensables aux volailles. Une vigilance s’impose aussi pour le maïs bio – en grains ou sous forme de produits transformés à partir de maïs - selon son origine géographique. »
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Un industriel de l’alimentation animale bio s’est vu reprocher, en 2008, d’avoir vendu des produits contaminés avec des OGM. Pourtant, les analyses pratiqués à l’usine montraient le zéro OGM, quand des prélèvements dans les exploitations livrées affichaient des contaminations forte de la fraction maïs ou soja. Les prélèvements et les analyses n’ont pas non plus été réalisés par le même organisme certificateur à l’usine et dans les fermes.
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Deux agriculteurs de Villiers-en-Plaine spécialisés dans la culture de maïs alimentaire biologique, ont appris la contamination de leur production de maïs par du maïs transgénique, alors que les parcelles de maïs OGM les plus proches sont officiellement distantes de plus de 35 kilomètres de leurs champs. C’est une analyse de routine, réalisée par leur coopérative, qui a permis de révéler cette contamination.
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En pleine discussion sur le Grenelle de l'environnement en 2007, l'information tombait comme un cheveu dans la soupe de ceux qui défendent l'idée d'une non-prolifération des OGM. Depuis deux ans une expérience était menée avec le soutien de la région Aquitaine sur une parcelle de maïs bio à Saint-Dos (64). Objectif : déterminer si oui ou non les OGM peuvent se retrouver dans les cultures bio. Résultat, contaminée au delà du seuil autorisé (0,14% de traces au lieu de 0,1%) la parcelle a été détruite immédiatement... Un suivi qui n'aura pas été sans créer des tensions dans un secteur où pro et anti OGM ne se font pas de cadeau: « J'ai reçu des menaces de mort. Notre parcelle a été vandalisée au moyen de produits chimiques pour empêcher l'apparition des maïs», a déclaré Bernard Pouey, l'agriculteur bio sur la propriété duquel l'expérience était menée. Un plainte a été déposée et des analyses sont en cours : « On est sûrs qu'il y a eu une pollution chimique volontaire pour empêcher les prelèvements», a précisé Jon Harlouchet, président de la Fédération des producteurs bio d'Aquitaine. Dans le Lot-et-Garonne, un autre site test avait lui aussi été vandalisé et n'a donné aucun maïs cette même année.
D'après La Dépêche du 8 octobre 2007
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2007 : ne parcelle de maïs bio du Loiret s’est trouvée contaminée, avec plus de 2% d’OGM détecté lors de l’analyse d’un premier échantillon, alors qu’aucune culture de maïs OGM proche n’était connue. Et quelle que soit la source de cette pollution, pollen ou semences, ce fait démontre l’impossible coexistence de l’agriculture biologique avec les cultures OGM.
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Observatoire des bio contaminés 
